Optimalizace multiplex PCR pro současnou detekci kolicinů a mikrocinů

Abstract

V teoretické části diplomové práce byla charakterizována bakterie Escherichia coli, producent antibakteriálních proteinů - bakteriocinů. Byly popsány základní vlastnosti kolicinů a mikrocinů, jejich klasifikace a detekce pomocí metody PCR, která je věnována část teoretické práce. Cílem praktické části bylo nejdříve ověřit metodou PCR identifikaci Escherichia coli u daného souboru kmenů izolovaných z potravin a ověřit specificitu primerů pro detekci E. coli na souboru kmenů E. coli a na souboru kmenů jiných než E. coli a dále optimalizovat multiplex PCR pro detekci bakteriocinů. Byl tedy sestaven systém pro detekci bakteriocinů. Použitím tohoto postupu bylo možno detekovat při jedné reakci dva různé bakteriociny. Tento systém byl aplikován na kolicinogenní kmeny E. coli izolované z chlazené drůbeže. Tyto kmeny produkují osm typů kolicinů a jeden typ mikrocinu. Nejčastěji byly zastoupeny koliciny E7, Ia a Ib.