Genotypizace izolátů Escherichia coli z potravin

Abstract

Escherichia coli je přirozenou součástí střevní mikroflóry teplokrevných živočichů, včetně člověka. Člověku je prospěšná nejenom produkcí látek působící antimikrobně vůči patogenním bakteriím, ale i účastí na tvorbě určitých vitamínů. Některé kmeny E. coli jsou ovšem patogenní a mohou způsobovat řadu intestinálních či extraintestinálních onemocnění. Cílem praktické části bylo provést u izolátů E. coli z potravin rozřazení do fylogenetických skupin (A, B1, B2, D), detekovat faktory virulence iss, papC, neuC, iucD, tsh, vat, u vybraných kmenů E. coli dále VT1, VT2, CNF1, CNF2, ST1, ST2, LT1, eaeA, Einv a Eagg a u kolicinogenních kmenů detekovat typ bakteriocinu (24 kolicinů a 8 mikrocinů), to vše metodou PCR. Fylogenetickou analýzou byla v potravinách prokázána přítomnost kmenů E. coli náležejících do virulentních extraintestinálních skupin B2 a D. Genotypizací byl rovněž potvrzen výskyt genů iss, papC, neuC, IucD, tsh, vat a eaeA. U kolicinogenních kmenů E. coli byla prokázána přítomnost genů na produkci mikrocinu V a kolicinů B, M, U, Y, Ia, Ib, E1, E2, E7 a E8.