Studium interakcí hyaluronan-hyaluronan metodou molekulové dynamiky (virtuální experiment)

Abstract

Bakalářská práce se zabývá vzájemnými interakcemi dvou řetězců hyaluronanu ve vodném prostředí o různých koncentracích chloridu sodného prostřednictvím softwaru pro moleku-lovou dynamiku NAMD. Teoretická část práce pojednává o kyselině hyaluronové, popisu-je princip molekulové dynamiky a jak může být při studiu kyseliny hyaluronové přínosná, a shrnuje poznatky z předchozích podobných zkoumání. V rámci praktické části je pak na dvou různých modelech - řetězce zcela volné a řetězce fixované v místech, kde se mezi nimi spontánně tvoří vodíkové vazby - při teplotě 275 K a různých koncentracích soli zkoumána četnost intermolekulárních vodíkových vazeb a vliv sodných iontů a molekul vody na tyto vazby.