Vliv iontů na sekundární strukturu hyaluronanu v počítačových simulacích a experimentech

Buš, Václav

Vliv iontů na sekundární strukturu hyaluronanu v počítačových simulacích a experimentech

DSpace Repository

Language: English čeština

Vliv iontů na sekundární strukturu hyaluronanu v počítačových simulacích a experimentech

dc.contributor.advisor	Kutálková, Eva
dc.contributor.author	Buš, Václav
dc.date.accessioned	2018-07-04T15:01:10Z
dc.date.available	2018-07-04T15:01:10Z
dc.date.issued	2018-02-02
dc.identifier	Elektronický archiv Knihovny UTB
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10563/42380
dc.description.abstract	Molekulová dynamika simuluje chování systémů na základě řešení pohybových rovnic jednotlivých atomů, přičemž vychází z párových vazebných a nevazebných interakcí mezi atomy. Díky nižší časové i finanční náročnosti oproti reálným experimentům jsou metody molekulové dynamiky stále častěji využívány ke studiu struktury a vlastností makromolekul. Cílem práce je popsat vliv různých iontů na strukturu hyaluronanu na základě simulací v programu NAMD, navrhnout charakteristiky náhodného klubka, které by možné srovnat s experimenty, a tyto charakteristiky následně naměřit pomocí dostupných experimentálních metod.
dc.format	59 s. (58 528 znaků)
dc.language.iso	cs
dc.publisher	Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně
dc.rights	Bez omezení
dc.subject	molekulová dynamika	cs
dc.subject	polysacharid	cs
dc.subject	gyrační poloměr	cs
dc.subject	hydrodynamický poloměr	cs
dc.subject	molecular dynamics	en
dc.subject	polysacharide	en
dc.subject	radius of gyration	en
dc.subject	hydrodynamic radius	en
dc.title	Vliv iontů na sekundární strukturu hyaluronanu v počítačových simulacích a experimentech
dc.title.alternative	Ion Effects on the Hyaluronan Secondary Structure in Computer Simulations and Experiments
dc.type	diplomová práce	cs
dc.contributor.referee	Ingr, Marek
dc.date.accepted	2018-06-05
dc.description.abstract-translated	Molecular dynamics is a technique for computer simulations of complex systems, based on the bonded and non-bonded interactions between all pairs of atoms. These methods are more and more often used to investigate the structure and properties of molecules, because computer modelling is faster and less expensive than real experiments. This thesis is focused on hyaluronan-ions effects using the molecular dynamics software NAMD. Appropriate characteristics of hyaluronan random coils ought to be suggested, calculated from simulations and measured using available experimental methods.
dc.description.department	Ústav fyziky a mater. inženýrství
dc.thesis.degree-discipline	Materiálové inženýrství	cs
dc.thesis.degree-discipline	Materials Engineering	en
dc.thesis.degree-grantor	Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně. Fakulta technologická	cs
dc.thesis.degree-grantor	Tomas Bata University in Zlín. Faculty of Technology	en
dc.thesis.degree-name	Ing.
dc.thesis.degree-program	Chemie a technologie materiálů	cs
dc.thesis.degree-program	Chemistry and Materials Technology	en
dc.identifier.stag	50236
utb.result.grade	A
dc.date.submitted	2018-05-14